Besançonin katedraali kohoaa majesteettisesti kaupungin sydämessä. Saint-Jeanin katedraali on silmiinpistävä esimerkki uskonnollisesta ja arkkitehtonisesta perinnöstä. Vaikka sen alkuperä juontaa juurensa 400-luvulle, sitä on rakennettu uudelleen ja laajennettu vuosisatojen aikana yhdistämällä sen romaaniset perustukset myöhempään gootti- ja barokkityyliin..

Yksi katedraalin merkittävimmistä piirteistä on sen harvinainen kaksoisapsimuotoilu, joka tekee siitä arkkitehtonisesti ainutlaatuisen Ranskassa.

Sisustus on koristeltu merkittävillä uskonnollisilla taideteoksilla. Kohokohta on kuuluisa 1800-luvulla valmistettu tähtitieteellinen kello, joka esittelee yksityiskohtaisia tähtitieteellisiä ja uskonnollisia toimintoja monimutkaisella vaihteisto- ja lukujärjestelmällään..

Besançonin arkkipiispan keskuksena toiminut katedraali on pitkään ollut hengellinen keskus. Citadelle de Besançonin läheisyys heijastaa myös historiallista kaksoisidentiteettiä kaupungin linnoitettuna ja uskonnollisena keskuksena.